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nihdff 2025-01-29 数据 36 views

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大家好,今天小编关注一个比较意思话题就是关于rnaseq数据分析流程的问题,于是小编就整理了2个相关介绍rnaseq数据分析流程的解答,让我们一起看看吧。

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(图片来源网络,侵删)
  1. 用qPCR验证RNA-Seq挑多少个基因合适?
  2. 医学大数据和传统的医学统计是什么关系?

用qPCR验证RNA-Seq挑多少个基因合适?

  做完RNA-Seq测序之后,往往会用QPCR来验证一下结果。

因为RNA-Seq测序数据得到的结果作为定量参考,参数的改变也会造成结果的不同。所以需要进行qPCR验证,表达水平的结果最终以实时定量PCR为准。一般需要验证基因的数目:20个左右 在验证时,往往会出现RNA-Seq测序结果和QPCR结果不一致的情况,遇到此类情况,因为这是正常现象(活久见)。原因可以查看我们之前的微信分享文章(戳这里)。一个事实,我们看到的很多SCI都有验证实验部分,并且文章中的结果居然都是很好!很多同学心里更加捉急,为嘛我的结果不符合预期,为嘛我的结果这么挫?! 其实呢也许作者验证了多个基因,结果选取了10个效果较好的,其他验证结果不好、与预期结果不符或者自己不能阐述清楚的部分基因则建议不在文章中呈现了。所以通常在文章中阐述了少数的几个,例如10个。具体验证多少个基因就要看准备发表的杂志水平和要求了。一般的文章验证20个左右就足够了。在RNA-Seq实验中设计生物学重复的,如果重复样本间相关系数高,只需要验证你关心的基因就行了。下面我们列出一些文献中用QPCR验证RNA-Seq的截图,包括Mrna、miRNA、Lnc-RNA,不难看出,很多基因QPCR的结果与RNA-seq是有出入的,乃们感受下。

医学大数据和传统的医学统计什么关系?

大数据分析和数据分析相比,一个“大”字就使得二者有完全的不同,但是又有一定的联系。有人说数据统计分析是大数据的初始阶段,也有人说二者本身并没有什么关系。这两种论述都是对的,为什么呢?

1、数据统计是大数据初始阶段的论述。一般是公司文员、财务分析等人员的说法。

  • 我们渐渐的体会到数据分析带来的红利,企图对一切事物进行建模,用数据分析决策,从这一点看,传统的数据统计确实是大数据的启蒙者。

  • 一般做数据统计分析的人员属于职能部门,与被公司奉为“宝贝儿”的技术部门比起来,难免妄自菲薄。会有意的强调自己从事的是技术行业,有意的说自己从事的是大数据。

2、数据统计与大数据分析没有丝毫关系。一般数据科学家、大数据从业人员的说法。

  • 大数据的持续火热,使从事大数据的群体有着划分界限的意识。从智联招聘、猎聘网公布的职位来看,数据统计从业人员一般就5000元薪酬/月,而大数据的从业人员薪酬基本都是20000元/月起步的。

  • 数据统计主要以excelspss、matlab为主,借用现成模块分析并不复杂的数据。而大数据分析首先要进行数据提取(比如你要分析一棵树,就需要对其数学解析)、然后数据清洗、设计程序(数据分析程序、一般以神经网络等为主)、分析结果(需要很强的发散性思维进行结果创新与包装)、决策。大数据明显包含的技术能力、逻辑能力、思维能力、想象能力更强更广。

所以,就看你怎么理解了,个人觉得没什么联系!

功能医学就是建立在科学和医学之上的保健学,也叫预防医学。简单的来说就是从一些保健品保健器械上,去预防可能发生的预知性的疾病,或者通过保健条件来增强健康。其领域包括基因环境饮食生活等,以预防为主。

理论上讲,这种防范于未然的方法是有其可行之处,只是现代人打着这种幌子大肆宣传一些无用的保健品,让大家对这个行业产生了误解甚至反感。

个人见解:

医学大数据和传统的医学统计,是一种联系紧密但又互相去同存异的关系。

其一,传统的医学统计的主要着眼于,统计描述,统计分析,统计推断。另外,也做一些研究设计,模型设计等。在一定程度上,是一个基础性、工具性的学科。其主要涉及数据分析软件为SAS SPSS STATA R语言等。所以说,可以片面的认为医学统计是医学大数据的基础。

其二,医学大数据这个概念太广了,包涵内容太多了,不知道版主指的哪一种。个人理解的为生物大数据。对于生物医学大数据的成因,主要有内外两方面:内因是生命本质的复杂性,包括生命内部运行机理的复杂、疾病病理的复杂等;外因可总结为生物/医学领域信息的数据化,这得益于高通量生物技术的发展医疗信息化以及信息技术(IT)的发展等。最典型是二代测序技术(如RNA-Seq)的成本下降及其应用普及,使得数据呈现爆炸性增长趋势。生物医学大数据的产生来源多样,涵盖临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场、个体行为与情绪研究、遗传学与组学研究、社会人口学、环境科学、健康网络与媒体等。

到此,以上就是小编对于rnaseq数据分析流程的问题就介绍到这了,希望介绍关于rnaseq数据分析流程的2点解答对大家有用。

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