如何快速从转录组数据中筛选目标基因!
1、序列比对:将已知的转录本序列作为查询序列,在其他物种的基因组数据中执行序列比对。
2、你想问哪方面呢?一般对基因功能的研究都会进行转基因功能分析,比如过表达、沉默表达后看转基因与野生型相关表型变化等。
3、般的转录组测序可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究目的。相信很多做过转录组测序的老师都深有体会。
4、一般都是利用生物信息学软件进行预测,但这种预测都是有局限性的,比如miRNA可能会与靶基因之间产生错配,这样会丢失一些靶基因,另外预测的都未经过实验的验证,还需要进行实验的验证来去伪存真。
5、在参考基因组和基因注释文件一文中有详细介绍如何在Ensembel数据库中获取参考基因组和基因注释文件。
6、利用dnastar快速筛选重复序列步骤如下:打开NCBI,搜索基因。找到该序列的CDS序列,输入到序列的标准格式的文件中,点击CDS序列,***该序列即可,输入到标准的SEQ格式中。
表格中怎么筛选出自己想要的内容
1、打开含有数据的excel表格,选取需要进行排列的数据所在的行或者列,可以把鼠标移动到列的最上端,出现黑色的箭头,点击选定所在的列。然后点击一下“ 筛选 ”。
2、使用筛选功能:在表格的首行或右列选择需要筛选的列,点击工具栏中的筛选按钮,如筛选、排序等,即可按要求筛选数据。
3、打开Excel表格;框选想要筛选的数据;点击数据栏下的筛选。然后勾选自己想要筛选出来的内容即可。筛选是一个很常用到的功能,可以快速地找出符合要求的数据。首先打开自己的Excel文档,找到自己的文档位置。
数据***图怎么筛选自己想要的数据
打开“员工基本信息表.xlsx”素材文件,选择数据区域中的任意单元格。
首先,打开待处理的excel文件,切换至“插入”选项卡,在“表格”选项组中单击“数据***表”按钮。弹出“创建数据***表”对话框,其中已经自动选择了表格区域,选中“现有工作表”单选按钮。
用EXCEL的数据***表功能,可以轻松实现筛选汇总,这比用筛选或用公式的方法做要高效、快捷得多。下面通过一个例子演示具体的操作方法。***设有这样一张表,需要统计每种水果的合计重量。
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